近頃この名前をよく聞くようになったので調べてみました。
「ヒトの腸管内では多種・多様な細菌が絶えず増殖を続けています。これらは腸内細菌と呼ばれ、個々の菌が集まって複雑な微生物生態系を構築しています。この微生物群集を「腸内フローラ」または「腸内細菌叢」と呼んでいます。(中略)このように、腸内フローラはヒトの健康と密接な関係があります。」(ヤクルト中央研究所HP)

ついでに商標出願状況を調べてみたら「美容も健康も腸内フローラから」(株式会社マンナンライフ)など9件存在しましたが、まだ1件も登録になっていないようです。
「腸内フローラカフェ」という不思議(不気味?)な出願もありました。

いずれにせよ名前は重要ですね。
「腸内細菌叢」(ちょうないさいきんそう)だと見向きもされないでしょうから。